Интерлейкин 28в. Фундаментальные исследования. Частота встречаемости в популяции

Ген интерлейкина 28B, II класс цитокиновых рецепторов (IL28B). Выявление мутации g.39738787C>T (rs12979860, регуляторная область гена)

Название гена - IL28B

Локализация гена на хромосоме - 19q13.2

Встречаемость в популяции

Встречаемость минорного (Т) аллеля в европейской популяции составляет 32 %.

Ассоциация маркера с заболеваниями

Маркер связан с генетической резистентностью к вирусным инфекциям и эффективностью лечения хронического гепатита С препаратами рибавирин ("Ребетол") и PEG-интерферон ("ПегИнтрон"). Полиморфизм IL28B определяет как вероятность самопроизвольной элиминации вируса, так и ответ на противовирусную терапию. Анализ назначается:

перед началом терапии хронического гепатита С – прогнозирование ответа на лечение;
при выборе тактики лечения хронического гепатита С.

Общая информация об исследовании

Вирус гепатита С в основном передается через кровь. Им поражено около 3 % населения мира. Инфекция вызывает острый гепатит и характеризуется отсутствием достаточного иммунного ответа. В 50-80 % случаев он переходит в хроническую форму и приводит к циррозу печени и гепатоцеллюлярной карциноме.

В настоящее время в качестве противовирусной терапии (ПВТ) гепатита С наиболее часто применяется сочетание двух препаратов – интерферона-альфа ("PEG-интерферона") и рибавирина, что подтверждается международными исследованиями и клинической практикой.

Основной задачей противовирусной терапии является профилактика цирроза печени и гепатокарциномы. Курс лечения хронического вирусного гепатита С продолжается 16-72 недели. При таком длительном применении данных препаратов развивается ряд выраженных побочных эффектов, так что в некоторых случаях лечение приходится прекратить. Эффективность противовирусной терапии зависит от многих факторов: генотипа вируса, исходной вирусной нагрузки, длительности инфицирования, обмена железа в организме, активности трансаминаз, избыточной массы тела, стеатоза печени, инсулинорезистентности, возраста, пола, алкогольной и наркотической зависимости, сопутствующих заболеваний, наличия выраженного фиброза.

Достижение устойчивого вирусологического ответа, а также определение риска побочных реакций при приеме противовирусных препаратов очень важны для больного. В последнее время, чтобы оценить эффективность начальной или повторной ПВТ, используют индивидуальный генетический фактор – статус гена IL28B . Наибольшее диагностическое значение он имеет при лечении ХГС, вызванного 1-м генотипом вируса. При ХГС, вызванном 2-м и 3-м генотипами вируса, полиморфизм гена IL28B значим только для пациентов, у которых не достигнут быстрый вирусологический ответ (отсутствие РНК вируса гепатита С на 4-й неделе лечения).

Распределение генотипов IL28B отличается в различных популяциях по всему миру и объясняет разную эффективность противовирусной терапии PEG-интерфероном и рибавирином в этнических группах.

При выявлении у пациента генотипа СС наблюдается:

двух-трехкратное увеличение вероятности формирования УВО на ПВТ;
вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей ТТ и СТ.

Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции.

Для пациентов с генотипами С/Т и Т/Т характерно снижение вероятности ответа на ПВТ, т. е. низкая эффективность лечения.

Метод определения Метод сиквенс-специфических праймеров, ПЦР.

Исследуемый материал Цельная кровь (с ЭДТА)

Доступен выезд на дом

ГЕПАТИТ С - инфекционное заболевание, которое у хронически инфицированных пациентов связано с риском развития цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы. Вирус гепатита С (HCV) имеет несколько генотипов, из них наиболее часто в нашей стране встречается вирус гепатита С генотипа 1.

Современная противовирусная терапия хронического гепатита С представляет собой комбинированную терапию пегилированным интерфероном (интерферон с добавленной молекулой полиэтиленгликоля и удлиненным эффектом) и рибавирином (PEG-IFN/RBV, ПЕГ ИФН/РИБ) и позволяет добиться успеха (устойчивого вирусологического ответа) у 40-60% пациентов.

Очевидно, что выявление факторов, влияющих на успех лечения, в том числе генетических, имеет большое значение, как для врача, которому необходимы объективные критерии прогноза эффективности лечения, так и для пациента, который перед началом проведения стандартной терапии должен быть информирован о вероятности ее успеха и побочном действии используемых противовирусных препаратов.

Генетические варианты, связанные с функциями определенных цитокинов, влияют на индивидуальные особенности иммунного ответа на данную инфекцию. IL28B представляет собой интерферон-λ-3 и является лигандом цитокинового рецептора II класса. Эти лиганды запускают JAK/STAT сигнальный каскад, активируя синтез 2’,5’-олигоаденилат-синтетазы, который активирует эндо-нуклеазу. Эндонуклеаза, в свою очередь, участвует в процессах стимуляции образования фермента протеинкиназы, который блокирует синтез вирусных белков.

Показано, что полиморфизмы, ассоциированные с геном IL28B, связаны с вероятностью самопроизвольной элиминации HCV и ответа на противовирусную терапию. Основную роль играют две замены: замена цитозина на тимин (C>T) в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860 и замена тимина на гуанин (T>G) в однонуклеотидном полиморфизме rs8099917.

По однонуклеотидному полиморфизму rs12979860 генотип С/С связан с вдвое более высокой вероятностью положительного ответа на лечение интерфероном и рибавирином, в то время как генотипы T/C и T/T в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение. Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции. Иммунная система носителей аллелей С/С более способна самостоятельно побеждать вирус. Интересно, что при генотипе С/С вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей Т/Т.

По однонуклеотидному полиморфизму rs8099917 генотип Т/Т связан со спонтанным разрешением инфекции, независимо от лечения, в то время как генотипы G/T и G/G в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение и достижения устойчивого вирусологического ответа. Аллель G в rs8099917 является аллелем риска и ассоциирован с низким уровнем ответа на терапию пегилированным интерфероном и рибавирином.

Исследования роли генетического полиморфизма указанных участков человеческого генома показали, что положительное предсказательное значение полиморфизма IL28B выше, чем других базовых характеристик, применяемых для прогноза успеха терапии (индекс массы тела, возраст, стадия фиброза и вирусная нагрузка). Однако, в исследованиях на больших популяциях больных хроническим гепатитом с различным клиническим профилем (стадия фиброза печени от 0 до 4, исходный уровень виремии низкий и высокий) было показано, что предсказательное значение генотипа пациента по IL28 для достижения устойчивого вирусологического ответа может существенно модифицироваться в зависимости от клинических характеристик и снижаться с 74,4% до 37,3% для пациентов с генотипом rs12979860 С/С. Поэтому генетические маркеры необходимо учитывать в комплексе с другими базовыми характеристиками конкретного пациента. Показано, что наибольшее значение полиморфизм IL28B имеет при инфицировании 1 субтипом HCV.

Определение генотипа пациента по IL28B поможет в принятии решения о применении стандартного курса терапии хронического гепатита С ПЕГ ИФН/РИБ и при необходимости индивидуальной оптимизации терапии за счет включения ингибиторов протеазы – телапревира и боцепревира.

Литература

1. Внутренние болезни по Тинсли Р.Харрисону. Практика 2005. 3388 с.

2. Ghary M.G. et al. Diagnosis, management and treatment of hepatitis C: an update. American Association for the Study of Liver Diseases. Hepatology. 2009, Apr; 49 (4): 1335-1374

3. Thomas D.L. et al. Genetic variation in IL28 B and spontaneous clearance of hepatitis C virus. Nature. 2009. Vol. 461, № 7265. P. 798–801.

4. Thompson A.J. et al. Interleukin-28 B polymorphism improves viral kinetics and is the strongest pretreatment predictor of sustained virologic response in genotype 1 hepatitis C virus. Gastroenterology. 2010, Jul; 139 (1): 120–129

5. Материалы производителя реагентов.

Горизонтальные табы

Описание

В настоящее время точно установлено, что изменения в кластере генов цитокинов (IL28A, IL28B и IL29), локализованных на 19 хромосоме (19q13) человека являются основным фактором, определяющим особенности противовирусной защиты организма. Наибольшее значение имеет полиморфизм в регионе, примыкающем к гену интерлейкина 28B (IL28B). Показано, что полиморфизмы IL28B определяют как вероятность самопроизвольной элиминации HCV, так и ответ на терапию интерфероном и рибавирином.
Основную роль при инфицировании гепатитом С играют две однонуклеотидные замены:
замена цитозина на тимин (C>T), имеющая обозначение rs12979860 в базе данных dbSNP национального центра биотехнологической информации США (National Center for Biotechnological Information, NCBI).
замена тимина на гуанин (T>G), имеющая обозначение rs8099917
Выявление полиморфизмов в гене IL28B - единственный рекомендованный фармакогенетический тест для инфицированных вирусом гепатита С. Согласно Рекомендациям по диагностике и лечению взрослых больных гепатитом С Минздрава России от 2013 года, «определение генотипа пациента по совокупности аллельных вариантов однонуклеотидных полиморфизмов rs12979860 и rs8099917 в гене интерлейкина 28 В (IL28В) по данным исследований для пациентов с генотипом 1 ВГС служит надежным предиктором достижения устойчивого вирусологического ответа на фоне проведения двойной и тройной противовирусной терапии».
Показано, что наибольшее значение полиморфизм IL28B имеет при инфицировании 1 субтипом HCV. На основании этого рекомендуется следующий алгоритм обследования при подготовке к лечению.

Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) в локусах rs8099917 и rs12979860 гена IL28B связаны с частотой спонтанного выздоровления при остром гепатите С и вероятностью достижения устойчивого ответа при лечении хронического гепатита С препаратами интерферона. Благоприятным генотипом является СС (по сравнению с СТ и ТТ) в локусе rs12979860 и ТТ (по сравнению с TG и GG) в локусе rs8099917.

Показания

Показания к назначению:

Прогнозирование исхода заболевания и ответа на лечение,
выбор между стандартным и пегилированным интерфероном в комбинации с рибавирином для лечения хронического гепатита С,
выбор тактики «ожидание доступности тройной терапии с включением ингибиторов протеазы HCV» или лечение стандартной схемой двойной терапии интерфероном в комбинации с рибавирином для пациентов дополнительными факторами (кроме фиброза печени), уменьшающими вероятность излечения препаратами существующего стандарта противовирусной терапии.

Интерпретация результатов

Название гена

IL28B OMIM - *607402

Локализация гена на хромосоме

Функция гена

Ген IL28B кодирует белок интерферон-лямбда-3, который является лигандом цитокинового рецептора II класса. IL28B запускает JAK/STAT-сигнальный каскад, передающий информацию от внеклеточных полипептидных сигналов к промоторам генов-мишеней, блокируя синтез вирусных белков.

Генетический маркер rs12979860

Участок ДНК в регуляторной области гена IL28B, в котором происходит замена нуклеотида цитозин (С) на тимин (Т), обозначается как генетический маркер g.39738787C>T или rs12979860.

Rs12979860 - обозначение однонуклеотидного полиморфизма по базе данных NCBI.

Возможные генотипы

Частота встречаемости в популяции

Частота встречаемости минорного (Т) аллеля в европейской популяции составляет 32 %.

Ассоциация маркера с заболеваниями

Маркер связан с генетической резистентностью к вирусным инфекциям и эффективностью лечения хронического гепатита С препаратами рибавирин («Ребетол») и PEG-интерферон («ПегИнтрон»). Полиморфизм IL28B определяет как вероятность самопроизвольной элиминации вируса, так и ответ на противовирусную терапию. Анализ назначается:

Перед началом терапии хронического гепатита С - прогнозирование ответа на лечение;

При выборе тактики лечения хронического гепатита С.

Описание

Вирус гепатита С в основном передаётся через кровь. Им поражено около 3 % населения мира. Инфекция вызывает острый гепатит и характеризуется отсутствием достаточного иммунного ответа. В 50-80 % случаев он переходит в хроническую форму и приводит к циррозу печени и гепатоцеллюлярной карциноме.

В настоящее время в качестве противовирусной терапии (ПВТ) гепатита С наиболее часто применяется сочетание двух препаратов - интерферона-альфа («PEG-интерферона») и рибавирина, что подтверждается международными исследованиями и клинической практикой.

Достижение устойчивого вирусологического ответа, а также определение риска побочных реакций при приёме противовирусных препаратов очень важны для больного. В последнее время, чтобы оценить эффективность начальной или повторной ПВТ, используют индивидуальный генетический фактор - статус гена IL28B. Наибольшее диагностическое значение он имеет при лечении ХГС, вызванного 1-м генотипом вируса. При ХГС, вызванном 2-м и 3-м генотипами вируса, полиморфизм гена IL28B значим только для пациентов, у которых не достигнут быстрый вирусологический ответ (отсутствие РНК вируса гепатита С на 4-й неделе лечения).

Распределение генотипов IL28B отличается в различных популяциях по всему миру и объясняет разную эффективность противовирусной терапии PEG-интерфероном и рибавирином в этнических группах.

При выявлении у пациента генотипа СС наблюдается:

двух-трёхкратное увеличение вероятности формирования УВО на ПВТ;
вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей ТТ и СТ.

Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции.

Интерпретация результатов

С/С - высокая вероятность эффективности противовирусного лечения
С/Т или Т/Т - низкая вероятность эффективности противовирусного лечения

Результаты исследования интерпретируются врачом в комплексе с другими генетическими, анамнестическими, клиническими и лабораторными данными.

Диагностическая значимость

Поскольку для гена IL28B известно несколько маркеров, расположенных в регуляторной области гена и определяющих характер его работы, исследование рекомендуется проводить в комплексе с маркером rs8099917.

Важные замечания

Для данного маркера не существует понятия «норма» и «патология», т. к. исследуется полиморфизм гена.

В диагностическом центре: взятие, либо самостоятельный сбор биоматериала осуществляется в диагностическом центре.

Самостоятельно: сбор биоматериала осуществляется самим пациентом (моча, кал, мокрота и т.п.). Другой вариант - образцы биоматериала предоставляет пациенту врач (например, операционный материал, ликвор, биоптаты и т.п.). После получения образцов пациент может как самостоятельно доставить их в диагностический центр, так и вызвать мобильную службу на дом для передачи их в лабораторию.

Вирусный гепатит С был объявлен европейской ассоциацией по изучению печени излечимым заболеванием. Это означает, что ограниченный по времени курс лечения противовирусными препаратами назначается пациенту один раз. В результате лечения достигается элиминация вируса из крови (устойчивый вирусологический ответ - УВО), нормализация биохимических показателей крови, улучшение состояния печени по данным УЗИ и эластометрии (снижение показателей фиброза вплоть до нормальных значений). Однако, УВО достигается не всегда. Кроме того, среди пациентов, прошедших курс стандартной противовирусной терапии, возможны рецидивы заболевания. В этих случаях назначаются повторные курсы лечения, которые часто приводят к достижению УВО.

Отсутствие адекватного анализа, позволяющего подтвердить выздоровление, а именно удаление вируса не только из крови, но и из печеночных клеток, заставляет гепатологов искать те факторы, которые влияют на прогноз эффективности лечения. К ним относятся факторы вируса - его генотип, и факторы хозяина. Среди этих факторов есть те, на которые нельзя влиять (пол, возраст, длительность заболевания, состояние печени на момент начала лечения), а также факторы, которые можно изменить (например, масса тела и особенности метаболизма).

Как показали исследования последних лет, особое влияние на результат лечения, а также возможность самостоятельного выздоровления при заражении вирусом гепатита С, оказывают генетические факторы, особенно полиморфизмы гена интерлейкина 28В. Интерлейкин 28В является представителем интерферонов-лямбда, или интерферонов 3 типа, обладающих сильным противовирусным действием и подавляющих репликацию вируса гепатита С.

Были изучены полиморфизмы гена интерлейкина 28В, связанные с устойчивым вирусологическим ответом. При определенных генотипах достижение устойчивого вирусологического ответа достигается в 2 раза чаще.

Изучение полиморфизма гена интерлейкина 28В наряду с другими факторами прогноза дает возможность более четко определить прогноз течения инфекции и эффективности лечения. Это важный шаг к индивидуализированной противовирусной терапии, позволяющий определять сроки лечения и дозы препаратов, не только увеличивая их, но и уменьшая.

Метод исследования: ПЦР - амплификация геномной ДНК человека в режиме реального времени.

Полимофизмы: