genoomitud – analüüsid ja hinnad. Alusuuringud Interleukiini geneetiline tüpiseerimine il 28b

Viimaste aastate uuringud on näidanud, et geneetilised tegurid, eriti interleukiin 28B geeni polümorfismid, mõjutavad ravi tulemust, aga ka infektsiooni korral enesetaastumise võimalust.

Interleukiin 28B on lambda interferoonide ehk 3. tüüpi interferoonide esindaja, millel on tugev viirusevastane toime ja mis pärsivad C-hepatiidi viiruse replikatsiooni. Uuriti püsiva viroloogilise vastusega seotud interleukiin 28B geeni polümorfisme. Teatud genotüüpide korral saavutatakse püsiv viroloogiline vastus 2 korda sagedamini.C-hepatiidi nakkuse puhul mängivad peamist rolli kaks üksikut nukleotiidi asendust:

Tsütosiini ja tümiini asendus (C>T) tähistatud riikliku biotehnoloogiateabe keskuse (NCBI) dbSNP andmebaasis rs12979860.

Guaniini (T>G) asendamine tümiiniga, tähis rs8099917

Sõltuvalt nende lookuste nukleotiididest tuvastati alleelid C (tsütosiin), T (tüümiin), G (guaniin) ja vastavad genotüübid: rs12979860 alleeli jaoks - CC, CT, TT, samuti TT, TG, GG jaoks. rs8099917 alleelid. et interleukiin 28B genotüüp on sõltumatu ja kõige olulisem tegur, mis mõjutab teiste prognostiliste tegurite hulgas AVT-le (viirusevastane ravi) varajase ja püsiva viroloogilise vastuse sagedust. Samal ajal vastutavad vastuse saamise eest rs12979860 polümorfismid, ja rs8099917 apolümorfismid on tihedalt seotud AVT-le reageerimise puudumisega.Sellest lähtuvalt soovitatakse ravi ettevalmistamisel läbi viia uuringud järgmise algoritmi järgi.

Patsiendi genotüübi määramine IL28B abil võib muuta raviotsuse algoritmi, muutes nii standardse PEG IFN/RIB ravikuuri kui ka CHC kolmikravi kestust. Ravi optimeerimine väldib paljusid lisaprobleeme patsientide ravis, kellel on suure tõenäosusega positiivne ravivastus (et vältida täiendavaid kõrvaltoimeid ja lisakulusid kolmikravi, sealhulgas proteaasi inhibiitorite - telapreviir ja botsepreviir) korral.

Patsiendi genotüübi määramine IL28B abil võib muuta raviotsuse algoritmi, muutes nii standardse PEG IFN/RIB ravikuuri kui ka CHC kolmikravi kestust. Ravi optimeerimine väldib paljusid lisaprobleeme patsientide ravis, kellel on suure tõenäosusega positiivne ravivastus (vältige täiendavaid kõrvaltoimeid ja lisakulusid kolmikravi, sealhulgas proteaasi inhibiitorite - telapreviir ja botsepreviir) korral.

2

1 FBSI "Rospotrebnadzori ennetavate terviseriskide juhtimise tehnoloogiate föderaalne teaduskeskus"

2 SBEE HPE "Permi osariigi meditsiiniakadeemia. ak. E.A. Wagner" Venemaa tervishoiuministeeriumist

3 Riigi Terviseasutus "Regionaalne Kliiniline Nakkushaigla"

Uuringu eesmärk. Uurida seost tsütolüüsi, kolestaasi, fibroosi, maksa regeneratsiooni ja interleukiin 28B (IL28B) geeni polümorfismi laboratoorsete markerite vahel rs12979860 piirkonnas kroonilise C-hepatiidi (CHC) patsientidel. Materjalid ja meetodid. Uuriti 100 CHC patsienti ja 90 tervet doonorit. Vereseerumis hinnati polümeraasi ahelreaktsiooniga maksafunktsiooni analüüse, hüaluroonhappe, alfa-fetoproteiini kontsentratsiooni ensüümi immuunanalüüsiga, viiruskoormuse taset ja IL28B geeni polümorfismi (rs12979860). Tulemused. CHC-ga patsientidel avastati tsütolüüsi ja kolestaasi sündroomid ning hüaluroonhappe ja alfafetoproteiini keskmine kontsentratsioon oli enam kui 2 korda kõrgem kui nende näitajate tase kontrollrühmas (p = 0,004 ja p = 0,0001). Üldiselt ei olnud IL28B (rs12979860) genotüüpide ja alleelide sagedustes statistiliselt olulist erinevust tervete isikute rühmade ja CHC-ga patsientide vahel. Sellegipoolest oli 71,4% hepatiidiga patsientidest CT ja TT genotüüpide ebasoodne kombinatsioon ja seega potentsiaalne risk negatiivse vastuse tekkeks viirusevastasele ravile, mille maksimaalne manifestatsioon TT homosügootides. Korrelatsioonianalüüsis näitas IL-28B geeni väike alleel T olulisi seoseid alaniini (r = 0,25, p = 0,02) ja asparagiinhappe (r = 0,22, p = 0,019) transaminaasidega, otsese bilirubiiniga (r = 0,019, 25). , p = 0,02), hüaluroonhape (r = 0,17, p = 0,03), alfa-fetoproteiin (r = 0,25, p = 0,02), viiruskoormus (r = 0, 25, p = 0,021). Järeldus. IL-28B geeni polümorfism on seotud maksakahjustuse raskusega CHC patsientidel.

krooniline C-hepatiit

interleukiini 28B geeni polümorfism

tsütolüüsi sündroom

kolestaas

hüaluroonhape

alfa-fetoproteiin

1. Abdurahhmanov D.T. Kroonilise C-hepatiidi ravi väljavaated // Kliiniline hepatoloogia. - 2010. - nr 3. - Lk 3–9.

2. Simankova T.V., Garmash I.V., Arisheva O.S., Manukhina N.V. IL-28B geeni polümorfism kui kroonilise C-hepatiidi viirusevastase ravi vastuse ennustaja. Klin. pharmacol. ter. - 2012. - nr 21 (1). – Lk 17–22.

3. Shchekotova A.P. Endoteeli düsfunktsiooni ja maksafibroosi markerite vastastikune seos viiruskoormusega kroonilise viirushepatiidi C korral // Teaduse ja hariduse kaasaegsed probleemid (elektrooniline ajakiri). 2012. Nr 1. URL: www.science-education.ru/101-5458.

4. Agúndez J.A., García-Martin E., Maestro M.L., Cuenca F., Martínez C. jt. IL28B geeni polümorfismi seos C-hepatiidi viirusest põhjustatud maksahaiguse biokeemiliste ja histoloogiliste tunnustega. http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0037998.

5. Eurich D., Boas-Knoop S., Bahra M., Neuhaus R., Somasundaram R., Neuhaus P., Neumann U., Seehofer D. IL28B polümorfismi roll C-hepatiidi viirusest põhjustatud hepatotsellulaarse kartsinoomi tekkes , siiriku fibroos ja siirdamisjärgne viirusevastane ravi. Siirdamine/ 2012 Mar 27;93(6):644–9.

6. Ge D., Fellay J., Thompson A. IL28B geneetiline varieeruvus ennustab C-hepatiidi ravist põhjustatud viiruse kliirensit // Nature. 2009 kd. 461. lk. 399–401.

7. McCarthy J., Li J., Thompson A. Replitseeritud seos IL28B geenivariandi ja püsiva vastuse vahel pegüleeritud interferoonile ja ribaviriinile // Gastroenteroloogia. 2010 Vol. 138. lk. 2307–2314.

8. Moliner L., Pontisso P., De Salvo G.L. et al. Seerumi ja maksa HCV RNA tase kroonilise C-hepatiidiga patsientidel: korrelatsioon kliiniliste ja histoloogiliste tunnustega // Soolestik. 1998. Vol. 42. lk. 856–860.

9. Perz J., Armstrong G., Farrington L. B-hepatiidi viiruse ja C-hepatiidi viirusnakkuste panus tsirroosi ja esmase maksavähi tekkesse kogu maailmas // J. Hepatol. 2006 kd. 45 lõige 4. rr. 529–538.

10. Statermayer A.F., Stauber R., Hofer H., Rutter K. jt. IL28B genotüübi mõju varajasele ja püsivale viroloogilisele vastusele kroonilise C-hepatiidiga varem ravimata patsientidel. Kliiniline gastroenteroloogia ja hepatoloogia. 2011. V. 4. Nr 3. http://health.elsevier.ru / ajakirjad.

11. Thomas D.L., Thio C.L., Martin M.P. IL28B geneetiline varieeruvus ja C-hepatiidi viiruse spontaanne kliirens // Loodus. 2009 kd. 461 (7265). rr. 798–801.

Viiruslik C-hepatiit on üks sotsiaalselt olulisi haigusi ja kroonilise maksahaiguse üks peamisi põhjuseid. WHO hinnangul on maailmas C-hepatiidi viirusega (HCV) nakatunud 170 miljonit inimest ehk 3% elanikkonnast. Praegu on kroonilise C-hepatiidi (CHC) viirusevastase ravi "kuldstandard" pegüleeritud interferoon kombinatsioonis ribaviriiniga. Kombineeritud viirusevastane ravi annab stabiilse viroloogilise vastuse keskmiselt 50-60% kroonilise C-hepatiidiga patsientidest, sealhulgas 40-50% HCV genotüübiga 1 ja 70-80% genotüübiga 2 ja 3. Individuaalne lähenemine ravile, kõrvalnähtude õigeaegne ennetamine ja korrigeerimine suurendab ravi efektiivsust, kuid peaaegu 40% juhtudest on viirusevastane ravi ebaefektiivne. Ilmunud on geneetiline marker, mis võimaldab osaliselt ennustada selle tulemust: interleukiin 28B geeni (IL28B) polümorfism määrab teatud määral patsiendi immuunsüsteemi tundlikkuse interferooniga stimuleerimise suhtes.

2009. aastal on D. Ge jt. leidis 19. kromosoomil IL28B-s ühe nukleotiidi asendus, mis lokaliseerimist arvesse võttes nimetati rs12979860. Sõltuvalt selles lookuses paiknevast lämmastiku alusest eraldati 2 alleeli: rs12979860 C (tsütosiin) ja rs12979860 T (tüümiin). Alleelide kombinatsiooni põhjal on võimalikud 3 geeni IL28B polümorfismi genotüübilist varianti: CC, CT ja TT. Sõltuvalt esinemissagedusest populatsioonis on rs12979860 C alleel peamine; esineb sagedamini ja rs12979860 T alleel on väike. On tõestatud, et positiivse vastuse sagedus viirusevastasele ravile on suurem rs12979860 CC genotüübiga patsientidel (70,5%) ja madalam rs12979860 CT ja TT genotüübiga patsientidel (vastavalt 32,0% ja 23,3%). T-alleeli kandmine, mis suurendab negatiivse vastuse tõenäosust viirusevastasele ravile, on olulisem kui C-alleeli "kaitseefekt". Sellegipoolest aitab CC genotüüp kaasa viiruse eliminatsioonile. IL28B geeni polümorfismi määramine võimaldas ennustada püsiva viroloogilise vastuse saavutamise tõenäosust tundlikkusega 65% ja spetsiifilisusega 78% selle geeni markeri rs12979860 puhul.

Selle markeri geneetilise polümorfismi määramine on kõige olulisem HCV 1. genotüübiga patsientide jaoks, arvestades madalamat ravivastuse määra standardsele viirusevastasele ravile. Mõned uuringud ei ole nendel patsientidel leidnud selget seost IL28B polümorfismi ja püsiva viroloogilise vastuse määra vahel. IL28B genotüübi määramine on väga oluline võimaliku ravivastuse hindamisel viirusevastasele ravile ja patsientide valikul, kes saavad kasu lühematest ravikuuridest. Üldiselt on IL28B polümorfism üks tegureid, mis võimaldavad kroonilise C-hepatiidi ravi individualiseerida. Kirjanduses on tõendeid selle kohta, et IL28B geeni polümorfism on seotud HCV-indutseeritud hepatotsellulaarse kartsinoomi tekkega. Seega tundub huvitav uurida selle geeni polümorfismi seost maksakahjustuse raskusastmega, eriti ebanormaalsete maksafunktsiooni testide, fibroosi ja maksa regeneratsiooni laboratoorsete testidega, mis aitavad selgitada IL28B polümorfismi rolli patogeneesis ja CHC progresseerumine.

Uuringu eesmärk oli uurida tsütolüüsi, kolestaasi, hüaluroonhappe (HA), alfa-fetoproteiini (AFP), viiruskoormuse (VL) ja IL28B geneetilise polümorfismi laboratoorsete markerite seost rs12979860 piirkonnas CHC patsientidel.

Uurimistöö materjalid ja meetodid

Uurisime 100 CHC-ga reaktivatsioonifaasis patsienti, kes hospitaliseeriti Permi piirkondlikus nakkushaiguste kliinilises haiglas, et alustada kombineeritud viirusevastast ravi. Patsientide keskmine vanus oli 38,3 ± 10,4 aastat, kellest 48 olid mehed ja 52 naised. Diagnoosi etioloogiline kontrollimine viidi läbi HCV RNA kvalitatiivse ja kvantitatiivse määramisega patsientide veres, kasutades polümeraasi ahelreaktsiooni (PCR), samuti HCV seroloogilisi markereid. HCV genotüübi järgi jaotati CHC-ga patsiendid järgmiselt: genotüüp 1 määrati 56% patsientidest, genotüüp 2 ja 3 - 44%. Sooliselt sobitatud kontrollrühma kuulus 90 näiliselt tervet (doonorit) indiviidi, kelle keskmine vanus oli 36,3 ± 7,9 aastat ilma maksahaiguseta.

Vere seerumi biokeemilised parameetrid määrati automaatse analüsaatoriga "Architect-4000" (USA). HA – maksafibroosi otsese markeri – taset vereseerumis hinnati BCM Diagnostics komplekti abil ensüümi immuunanalüüsi abil Stat-Fax analüsaatoril (USA) 76 patsiendil. AFP kontsentratsiooni vereseerumis uuriti immunokemiluminestsentsanalüüsiga, kasutades AFP komplekti (Siemens) Immulite-1000 analüsaatoril (Saksamaa) 44 patsiendil. Kontrollrühmas uuriti HA ja AFP kontsentratsiooni 20 praktiliselt tervel inimesel.

IL28B geeni rs12979860 markeri polümorfsete variantide tuvastamiseks kasutati alleelispetsiifilist PCR-i koos toote reaalajas tuvastamisega. Praimerite ja sondide projekteerimise viisid läbi CJSC Syntol (Moskva) töötajad. (USA). Selle geeni genotüüpide määramiseks kõigil CHC-ga patsientidel ja 90 tervel doonoril eraldati DNA eelnevalt EDTA-ga stabiliseeritud venoossest täisverest.

Saadud tulemuste statistiline töötlemine viidi läbi programmi Statistica 7.0 (StatSoft) abil. Tulemuste jaotust kontrolliti Kolmogorovi–Smirnovi kriteeriumi järgi. Saadud kvantitatiivsete tunnuste kirjeldamiseks esitati andmed mediaanina (Me) ning 25. ja 75. protsentiili, miinimumi (min) ja maksimumina (max). Kuna GA ja AFP väärtuste jaotus erines normaalsest, kasutati sõltumatute rühmade vaheliste erinevuste olulisuse hindamiseks mitteparameetrilist Mann-Whitney testi. Genotüüpide ja geenide alleelide sageduste suhte kirjeldamiseks kasutati Hardy-Weinbergi tasakaalu. Uuritud rühmad olid uuritava geeni genotüübi sageduste osas (p > 0,05) tasakaalus (stabiilses) seisundis. Erinevused kahes populatsioonis arvutati koefitsientide suhte (OR) abil, kasutades juhtumikontrolli meetodit erinevate pärimismustrite jaoks: aditiivne, tavaline, korduv, domineeriv ja retsessiivne, ning neid peeti oluliseks p juures.< 0,05. Количественная оценка линейной связи между двумя независимыми величинами определялась с использованием коэффициента ранговой корреляции по Спирмену (r). Значимость взаимосвязей и различия между выборками считались достоверными при значении для р < 0,05.

Uurimistulemused ja arutelu

Võttes arvesse CHC-ga patsientide vere biokeemilisi parameetreid, avastati tsütolüüsi sündroom, mida iseloomustas alaniini (ALT) ja asparagiinhappe transaminaaside (AST) aktiivsuse tõus vereseerumis, mesenhümaalne põletikuline sündroom (an tümoolitesti tõus) ja kolestaasi sündroom (aluselise fosfataasi, otsese bilirubiini aktiivsuse suurenemine).

CHC-ga patsientide rühmas täheldati HA sisalduse suurenemist, mis peegeldab fibroosi aktiveerumist kroonilise maksapõletiku taustal, samal ajal kui HA keskmine kontsentratsioon veres oli 2 korda kõrgem kui veres. kontrollrühm (p = 0,01) (tabel 1). AFP kontsentratsioon hepatotsüütide regeneratsiooni markerina CHC patsientidel oli samuti oluliselt kõrgem kui kontrollrühmas.

CHC-ga patsientide vireemia näitas VL suuri erinevusi. VL tase 70% patsientidest oli kõrge – üle 2∙106 koopia/ml, 30% juhtudest madal – alla 2∙106 koopia/ml. Samal ajal oli minimaalne vireemia 0,022∙106, maksimaalne - 8800∙106 koopiat/ml. CHC taasaktiveerimise ajal uuritud vireemia varieeruvus on kooskõlas kirjanduse andmetega.

Tabel 1

Hüaluroonhape ja alfa-fetoproteiin CHC patsientidel ja kontrollrühmas

Märge. p - näitaja erinevuste olulisus uuritud rühmades arvutati Mann-Whitney testi abil.

Käesolevas uuringus analüüsisime ühe nukleotiidi asendust (SNP) IL-28B geenis (rs12979860) 190 isikul (90 kroonilise maksahaiguseta doonorit ja 100 CHC-ga patsienti).

C-alleeli (CC) homosügootide levimus tervete ja CHC-ga patsientide rühmas ei erinenud oluliselt (χ2 = 0,61; p = 0,44) ning moodustas vastavalt 42 ja 36% (joonis). Patoloogiliste TT homosügootide esinemissagedus tervete ja CHC patsientide rühmas oli vastavalt 6% ja 8% (χ2 = 0,35; p = 0,55). Mõlemas rühmas domineerisid ST heterosügootid (χ2 = 0,79; p = 0,67). Ka uuritud markeri alleelisageduste suhet uuritud rühmades ei iseloomustatud erinevusega. Patoloogilise väiksema alleeli T esinemissagedus CHC rühmas oli 36%, kontrollrühmas 32% (χ2 = 0,64; p = 0,42). IL-28B (rs12979860) genotüüpide ja alleelide esinemise kohta nii tervetel inimestel kui ka CHC rühmas Permi territooriumi elanikkonna hulgas saadud tulemused praktiliselt ei erine teiste autorite andmetest. Eelkõige Venemaal on kaitsva alleeli C levimus elanikkonnas 61–64%, meie uuringutes - 64% CHC-ga patsientidel ja 61% kontrollrühmas. Seega ei leitud uuringu käigus statistiliselt olulist erinevust IL-28B markeri (rs12979860) genotüüpide ja alleelide sagedustes tervete ja CHC-ga indiviidide rühmade vahel. CHC-ga patsientide rühmas oli riskialleeli T esinemissagedus 0,359, mis ei erinenud oluliselt selle esinemissagedusest 0,319 tervete inimeste seas. 56-st HCV-1-ga nakatunud patsiendist oli 40 inimesel rs12979860 CT ja TT genotüüpide ebasoodne kombinatsioon (vastavalt 35 ja 5), ​​mis erines oluliselt kontrollrühmast (χ2 = 4,55; p = 0,03). Seega oli potentsiaalne risk ebastabiilse viroloogilise vastuse tekkeks HCV genotüübiga 1 71,4%.

IL-28B geeni (rs12979860) polümorfismi genotüüpide ja alleelide levimus CHC patsientidel ja kontrollrühmas

Korrelatsioonianalüüsis näitas IL-28B geeni väike alleel T (rs12979860) olulisi korrelatsioone funktsionaalsete maksaanalüüsidega: ALT, AST, üld- ja otsebilirubiin, mis näitab seost geeni polümorfismi ja maksakahjustuse raskusastme vahel. Need andmed viitavad ka tsütolüüsi ja kolestaasi raskusastme ebasoodsale mõjule viirusevastase ravi prognoosile (tabel 2). Saadud tulemused on kooskõlas Agundez J.A. uuringu andmetega. et al. (2009), kes paljastas geenide polümorfismi seose ALT, gamma-glutamüültranspeptidaasi, AST/ALT suhtega.

tabel 2

IL-28B geeni väiksema alleeli T (rs12979860) seosed funktsionaalsete maksatestide, hüaluroonhappe ja alfafetoproteiiniga CHC-s

Märkused: r - näitajate seos; p on korrelatsiooni olulisus.

Positiivne märkimisväärne korrelatsioon T-alleeli ja HA vahel näitab, et uuritavat geeni saab hinnata maksafibroosi progresseerumise tegurina. Korrelatsioon AFP-ga viitab ka geenipolümorfismi seosele tugevama maksakahjustuse ja hepatokartsinoomi riskiga. Eurich D. et al. (2012) leidsid seose IL-28B ja AFP vahel CHC-ga seotud hepatokartsinoomi korral ja fibroosi progresseerumisega HCV infektsiooniga patsientidel pärast maksa siirdamist. T-alleeli seos VL tasemega võib viidata raskemale hepatotsüütide kahjustusele CHC-ga patsientidel, mis on kooskõlas tuvastatud seosega HA ja vireemia astme vahel. Üldiselt näitavad T-geeni väiksema alleeli tuvastatud seosed uuritud testidega, et IL-28B geneetiline polümorfism võib realiseeruda kaudselt mitmete CHC patogeneesis osalevate ja viirusevastase ravi efektiivsust mõjutavate parameetrite kaudu. Nende tegurite hulka kuuluvad tsütolüüsi ja kolestaasi sündroomide esinemine, maksafibroosi raskusaste, hepatotsüütide regeneratsiooni aktiveerimine ja VL tase.

Seega on IL-28B geeni (rs12979860) polümorfism seotud CHC-ga patsientide maksakahjustuse raskusastmega, mida tuleb arvesse võtta, et otsustada ravi optimeerimise üle nende tegurite ebasoodsa kombinatsiooni korral, eriti väikese T-alleeliga patsientidel.

1. Reaktivatsioonifaasis CHC-ga patsientidel tuvastati HA ja AFP tõus, mis viitab fibroosi aktiveerumisele ja regeneratsioonile maksas.

2. Uuringu käigus ei leitud statistiliselt olulist erinevust IL-28B geeni (rs12979860) genotüüpide ja alleelide esinemissageduses tervete indiviidide rühmade ja erinevate viiruse genotüüpidega CHC-ga patsientide vahel.

3. 71,4%-l HCV-1-ga nakatunud patsientidest esines rs12979860 CT ja TT genotüüpide ebasoodne kombinatsioon ning sellest tulenevalt ka potentsiaalne risk negatiivse vastuse tekkeks viirusevastasele ravile koos selle maksimaalse avaldumisega TT homosügootides.

4. Kroonilise C-hepatiidiga patsientidel leiti korrelatsioon IL-28B geeni väiksema alleeli T (rs12979860) ning tsütolüüsi ja kolestaasi sündroomide raskusastme, maksafibroosi ja regeneratsiooni markerite ning vireemia taseme vahel. .

5. HCV 1. genotüübiga CHC-ga patsientidel on viirusevastase ravi prognoosi määramiseks ja ravi optimeerimise probleemi lahendamiseks vaja hinnata tegurite kombinatsiooni: tsütolüüsi ja kolestaasi raskusastet, HA kontsentratsiooni, AFP ja vireemia esialgne tase, eriti patsientidel, kellel on IL-28B geeni väike alleel T.

Arvustajad:

Ustinova O.Yu., meditsiiniteaduste doktor, professor, meditsiinitöö asedirektor, FBSI "Rahvastiku terviseriskide juhtimise meditsiini- ja ennetustehnoloogiate föderaalne teaduskeskus", Perm;

Gein SV, meditsiiniteaduste doktor, juhtivteadur, mikroobide arengu biokeemia labor, Mikroorganismide ökoloogia ja geneetika instituut, Venemaa Teaduste Akadeemia Uurali filiaal, Perm.

Töö jõudis toimetusse 16.12.2013.

Bibliograafiline link

Bulatova I.A., Krivtsov A.V., Shchekotova A.P., Larionova G.G., Shchekotov V.V. MAKSAKAGASTUSTE RASEDUSE SEOS GEENI INTERLEUKIIN 28B POLÜMORFIMISEGA KROONILISE HEPATIIT C-GA PATSIENTIDEL // Fundamentaaluuringud. - 2013. - nr 12-2. - S. 186-190;
URL: http://fundamental-research.ru/ru/article/view?id=33301 (juurdepääsu kuupäev: 01.02.2020). Juhime teie tähelepanu kirjastuse "Looduslooakadeemia" väljaantavatele ajakirjadele

Määramise meetod Järjestusspetsiifiliste praimerite meetod, PCR.

Uuritav materjal Täisveri (EDTA-ga)

Võimalik kodukülastus

C-HEPATIIT on nakkushaigus, mis krooniliselt nakatunud patsientidel on seotud maksatsirroosi ja hepatotsellulaarse kartsinoomi tekkeriskiga. C-hepatiidi viirusel (HCV) on mitu genotüüpi, millest meil levinuim on C-hepatiidi viiruse genotüüp 1.

Kroonilise C-hepatiidi kaasaegne viirusevastane ravi on kombineeritud ravi pegüleeritud interferooniga (interferoon, millele on lisatud polüetüleenglükoolimolekuli ja pikendatud toime) ja ribaviriiniga (PEG-IFN / RBV, PEG IFN / RIB) ning võimaldab saavutada edu (püsiv viroloogiline vastus ) 40–60% patsientidest.

Ilmselgelt on ravi edukust mõjutavate tegurite, sh geneetiliste tegurite väljaselgitamine väga oluline nii arsti jaoks, kes vajab ravi efektiivsuse prognoosimiseks objektiivseid kriteeriume, kui ka patsiendile, keda tuleb enne standardravi alustamist teavitada. selle õnnestumise tõenäosuse ja kasutatavate viirusevastaste ravimite kõrvalmõjude kohta.

Teatud tsütokiinide funktsioonidega seotud geneetilised variandid mõjutavad antud infektsiooni immuunvastuse individuaalseid omadusi. IL28B on interferoon-λ-3 ja II klassi tsütokiini retseptori ligand. Need ligandid käivitavad JAK/STAT signaaliülekande kaskaadi, aktiveerides 2',5'-oligoadenülaadi süntetaasi, mis aktiveerib endonukleaasi. Endonukleaas omakorda osaleb proteiinkinaasi ensüümi moodustumise stimuleerimise protsessides, mis blokeerib viirusvalkude sünteesi.

On näidatud, et IL28B geeniga seotud polümorfismid on seotud HCV spontaanse eliminatsiooni tõenäosusega ja vastusega viirusevastasele ravile. Peamist rolli mängivad kaks asendust: tsütosiini asendus tümiiniks (C>T) ühe nukleotiidi polümorfismis rs12979860 ja tümiini asendus guaniiniks (T>G) ühe nukleotiidi polümorfismis rs8099917.

Ühe nukleotiidi polümorfismi rs12979860 puhul on C/C genotüüp seotud kahekordse positiivse vastuse tõenäosusega interferooni ja ribaviriiniga ravile, samas kui T/C ja T/T genotüübid selles asendis on seotud väiksema vastuse tõenäosusega. ravile. CC genotüüp tuvastatakse peamiselt inimestel, kellel on nakkus spontaanselt taandunud. C/C alleeli kandjate immuunsüsteem on võimeline viirust iseseisvalt alistama. Huvitav on see, et C/C genotüübi puhul on viiruskoormus (viiruse hulk veres) enne ravi suurem kui T/T alleelide kandjatel.

Vastavalt ühe nukleotiidi polümorfismile rs8099917 on T/T genotüüp seotud infektsiooni spontaanse lahenemisega, sõltumata ravist, samas kui G/T ja G/G genotüübid selles asendis on seotud väiksema tõenäosusega reageerida ravile ja püsiva viroloogilise vastuse saavutamine. G-alleel rs8099917-s on riskialleel ja seda seostatakse halva vastusega pegüleeritud interferooni ja ribaviriini ravile.

Uuringud geneetilise polümorfismi rolli kohta nendes inimgenoomi piirkondades näitasid, et IL28B polümorfismi positiivne ennustusväärtus on kõrgem kui teistel põhinäitajatel, mida kasutatakse ravi edukuse ennustamiseks (kehamassiindeks, vanus, fibroosi staadium ja viiruskoormus). . Erineva kliinilise profiiliga kroonilise hepatiidi (maksafibroosi staadium 0 kuni 4, vireemia esialgne tase on madal ja kõrge) patsientidega läbiviidud uuringutes aga selgus, et patsiendi IL28 genotüübi prognoositav väärtus püsiva viroloogilise vastuse saavutamist saab kliinilistest omadustest sõltuvalt oluliselt muuta ja rs12979860 C/C genotüübiga patsientide puhul väheneda 74,4%-lt 37,3%-le. Seetõttu tuleb geneetilisi markereid arvesse võtta koos teiste konkreetse patsiendi põhiomadustega. On näidatud, et IL28B polümorfismi väärtus on suurim, kui see on nakatunud HCV alatüübiga 1.

Patsiendi genotüübi määramine IL28B abil aitab otsustada kroonilise C-hepatiidi standardse ravikuuri kasutamise üle PEG IFN/RIB-ga ja vajadusel individuaalselt optimeerida ravi proteaasi inhibiitorite – telapreviiri ja botsepreviiri – kaasamise teel.

Kirjandus

1. Sisehaigused Tinsley R. Harrisoni järgi. Praktika 2005. 3388 lk.

2. Ghary M.G. et al. C-hepatiidi diagnoosimine, juhtimine ja ravi: värskendus. Ameerika maksahaiguste uurimise ühing. hepatoloogia. 2009, aprill; 49(4): 1335-1374

3. Thomas D.L. et al. IL28 B geneetiline varieeruvus ja C-hepatiidi viiruse spontaanne kliirens. Loodus. 2009 kd. 461, nr 7265. Lk 798–801.

4. Thompson A.J. et al. Interleukiin-28 B polümorfism parandab viiruse kineetikat ja on 1. genotüübi C-hepatiidi viiruse püsiva viroloogilise vastuse tugevaim ravieelne ennustaja. gastroenteroloogia. 2010 juuli; 139(1): 120–129

5. Reaktiivi tootja materjalid.

Interleukiin-28B (genotüpiseerimine) (HCV ravi prognoos)


Analüüsi kirjeldus:

Interleukiin-28B (genotüpiseerimine) - test interleukiin 28B funktsioonidega seotud geneetiliste polümorfismide määramiseks PCR-iga (polümeraasi ahelreaktsioon).

Patsiendi genotüübi määramine IL28B abil võib muuta raviotsuse algoritmi, muutes nii standardse PEG IFN/RIB ravikuuri kui ka CHC kolmikravi kestust. Ravi optimeerimine väldib paljusid lisaprobleeme patsientide ravis, kellel on suure tõenäosusega positiivne ravivastus (vältimaks täiendavaid kõrvaltoimeid ja lisakulusid kolmikravile proteaasi inhibiitorite - telapreviiri ja botsepreviiri - kaasamisega).

Näidustused

  • Viiruslik C-hepatiit.
  • Viirusliku C-hepatiidi ravi prognoos.
  • Ebapiisav immunoloogiline reaktsioon ettenähtud ravile.

Materjal uurimistööks: kogu veri.

Ettevalmistus uuringuks: vereproovid võetakse rangelt tühja kõhuga (vähemalt 8 tundi pärast viimast sööki).

Tulemuse tõlgendamine:

Polümorfism:

Polümorfismi võimalikud ilmingud

Interleukin-28B (RS8099917)

Avastati GG genotüüp

Halb vastus interferooni ja ribaviriini ravile

Avastati TG genotüüp

Vähenenud ravivastus interferooni ja ribaviriini ravile

TT genotüüp avastati

Võimalik infektsiooni spontaanne lahenemine

Interleukin-28B (RS12979860)

CC genotüüp avastati

1. Infektsiooni võimalik spontaanne taandumine

2. Umbes 80% CHC patsientidest reageerib ravile

3. Iseloomulik on kõrge viiruskoormus

CT genotüüp avastati

20–40% CHC patsientidest reageerib ravile

TT genotüüp avastati

20–25% CHC patsientidest reageerib ravile


KOOD: 721
Toru värv: F
Maksumus: 770

Pange tähele, et saidil näidatud hinnad võivad ametlikust hinnakirjast veidi kõrvale kalduda.
Vladivostokil ja Artemil on nüüd võimalus kodus analüüsid teha (vereproovid).
+ Uurimistöö tähtajad
  • Biokeemilised, hematoloogilised, üldised kliinilised uuringud, koaguloloogilised uuringud, immunokeemilised - 1 tööpäev**
  • ELISA diagnostika, PCR-määrded - 2 tööpäeva**
  • PCR-veri, allergia diagnostika - kuni 3 tööpäeva**
  • Voolutsütomeetria - kuni 2 tööpäeva**
  • Immunoloogilised uuringud - kuni 5 tööpäeva**
  • Bakterioloogiline uuring - kuni 7 tööpäeva**
  • Bioloogilise suhte geneetiline diagnoos - kuni 21 tööpäeva**
  • Molekulaargeneetilised vereanalüüsid ilma järelduseta - kuni 5 tööpäeva**
  • Molekulaargeneetilised vereanalüüsid järeldusega - kuni 21 tööpäeva**
  • Väga spetsiifilised immunoloogilised uuringud - vereproovide võtmine immunoloogilisteks uuringuteks toimub iga päev ja ainult eraldi tuubis. Uuringud toimuvad kord nädalas, teisipäeviti, tulemus väljastatakse alates kolmapäevast pärast kella 13.00 .
  • Geneetiline diagnostika - uuringute täieliku loetelu koos hindadega saab alla laadida veebisaidilt Uuringud viiakse läbi INTO-Steel LLC kolmanda osapoole geenilaboris.

* * Uurimise tähtaegu arvestatakse materjali laborisse saabumise hetkest, arvestamata materjali võtmise päeva. Teistest haiglatest tarnimisel võivad tähtajad tarneaja tõttu pikeneda.

+ Selgitused, vastavalt katseklaasi värvi tähistusele
  • K - punase korgiga katseklaas, seerumi saamiseks;
  • F - lilla korgiga katseklaas, plasma saamiseks ja täisvere uurimiseks;
  • H - musta korgiga katseklaas, ESR-i taseme uurimiseks;
  • G - kollase korgiga katseklaas, uriiniproovide uurimiseks;
  • C - halli korgiga katseklaas, glükoosi taseme määramiseks;
  • Z - rohelise korgiga katseklaas, elektrolüütide ja immunoloogiliste uuringute jaoks;
  • G - sinise korgiga katseklaas, hüübimisuuringute jaoks;
  • B – konteiner biomaterjali jaoks (steriilne);
  • M - määrida (ettevalmistus) erineva lokaliseerimisega klaasslaidil;
  • SL - katseklaas sülge koguma;
  • TRS - transport vedel keskkond;
  • T/G – sond-tampoon steriilne in vitro (geeliga);
  • P - film enterobiaasi kraapide võtmiseks.
+ Bioloogilise materjali kogumispunktid
PRIMORSKY KRAI
Vladivostok

Horisontaalsed sakid

Kirjeldus

Nüüdseks on hästi teada, et inimese 19. kromosoomi (19q13) lokaliseeritud tsütokiini geenide (IL28A, IL28B ja IL29) klastris on organismi viirusevastase kaitse tunnuseid peamiseks teguriks. Interleukiin 28B (IL28B) geeniga külgneva piirkonna polümorfism on kõige olulisem. On näidatud, et IL28B polümorfismid määravad nii HCV spontaanse eliminatsiooni tõenäosuse kui ka vastuse interferoon- ja ribaviriinravile.
Peamist rolli C-hepatiidi infektsioonis mängivad kaks üksikut nukleotiidi asendust:
tsütosiini ja tümiini asendus (C>T), mis on riikliku biotehnoloogilise teabe keskuse (NCBI) dbSNP andmebaasis tähisega rs12979860.
tümiini asendamine guaniiniga (T>G), mille nimetus on rs8099917
Polümorfismide tuvastamine geenis IL28B on C-hepatiidi viirusega nakatunute jaoks ainuke soovitatav farmakogeneetiline test.Venemaa tervishoiuministeeriumi 2013. aasta C-hepatiidi täiskasvanud patsientide diagnoosimise ja ravi soovituste kohaselt on „määramine Patsiendi genotüüp ühe nukleotiidi polümorfismide rs12979860 ja rs8099917 alleelsete variantide alusel interleukiin 28 B geenis (IL28B) HCV 1. genotüübiga patsientidel on kahe- ja kolmikravi ajal püsiva viirusevastase ravivastuse saavutamise usaldusväärne ennustaja.
On näidatud, et IL28B polümorfismi väärtus on suurim, kui see on nakatunud HCV alatüübiga 1. Sellest lähtuvalt on ravi ettevalmistamisel soovitatav kasutada järgmist uurimisalgoritmi.

Ühe nukleotiidi polümorfismid (SNP-d) IL28B geeni rs8099917 ja rs12979860 lookustes on seotud ägeda C-hepatiidi spontaanse paranemise sagedusega ja kroonilise C-hepatiidi ravis interferoonipreparaatidega püsiva ravivastuse saavutamise tõenäosusega. Soodne genotüüp on CC (võrreldes CT ja TT) rs12979860 lookuses ja TT (versus TG ja GG) rs8099917 lookuses.

Näidustused

Näidustused kohtumiseks:

  • Haiguse tulemuse ja ravivastuse ennustamine,
  • valik standardse ja pegüleeritud interferooni vahel kombinatsioonis ribaviriiniga kroonilise C-hepatiidi raviks,
  • taktika valik "oodates kolmikravi kättesaadavust koos HCV proteaasi inhibiitorite lisamisega" või ravi standardse topeltravi režiimiga interferooni ja ribaviriini kombinatsiooniga patsientidele, kellel on täiendavad tegurid (välja arvatud maksafibroos), mis vähendavad tõenäosust ravi olemasoleva viirusevastase ravi standardiga ravimitega.
Tulemuste tõlgendamine
Laadimine...Laadimine...
Lehe ülaosa